無菌均質(zhì)器又叫拍打式均質(zhì)器，或無菌均質(zhì)機。無菌均質(zhì)器使從固體樣品中提取細菌的過程變得簡單，只需將樣品和稀釋液加入到無菌的樣品袋中，然后將樣品袋放入拍擊式均質(zhì)器中即可完成樣品的處理。有效地分離被包含在固體樣品內(nèi)部和表面的微生物均一樣品，確保無菌袋中混合全部的樣品。處理后的樣品溶液可以直接進行取樣和分析，沒有樣品的變化和交叉污染的危險。

微生物樣品的原始狀態(tài)可能是塊狀、糊狀、粉末狀等等，都須將其制成細化的液體狀樣品，才能有利于微生物的分析和接種。拍打式無菌均質(zhì)器工作原理是：將原始樣本（大的需要剪成約10×10mm塊狀），與某種液體或溶劑放入均質(zhì)袋，經(jīng)本儀器拍打式無菌均質(zhì)器的錘擊板反復在樣品均質(zhì)袋上錘擊，產(chǎn)生壓力、引起振蕩、加速混合、從而達到溶液中微生物成分處于均勻分布狀態(tài)。拍打式無菌均質(zhì)器適用于腦、腎、肝、脾等組織及微生物的均質(zhì)處理，廣泛應用于食品、臨床、分子學、毒素及細菌檢測等領域。
存放原始樣品物質(zhì)和溶劑的均質(zhì)袋，由特殊材料制成，已無菌處理（已開封的均質(zhì)袋用戶應再次消毒滅菌以確保無菌），通過均質(zhì)器門上沿部位的橫桿進行裝夾密封，可避免在錘擊板錘擊時溶液的溢出，均質(zhì)器的拍擊板不停地在均質(zhì)袋上錘擊，產(chǎn)生的壓力可將袋中的樣品擊碎混勻。均質(zhì)速度可編程設定，每段可設3~12次/秒，均質(zhì)時間每一段可設定為1秒~100分鐘或連續(xù)運行，用戶可根據(jù)樣品和溶劑情況進行合理的選擇，以達到Z佳的均質(zhì)效果。例如：小鼠、大鼠的肝臟定時設3分鐘，中速6~10次/秒即可。